2020年4月17日（金）超！神様アイドルプロジェクトの公式Twitterにおいて、2020年1月17日（金）から家庭の事情で活動を休止していた山本かなたがグループから脱退すると発表された。

脱退について、公式Twitterのコメントでは

今回のコロナウィルスの影響で更に復帰の目処が立たなくなったことにより本人から脱退の申し出があり、それを了承したことをご報告させて頂きます。

氏っ子の皆さまへ　より抜粋

と復帰の目処が立たなくなったための脱退と説明をしている。

一方で

本人のやる気に対して環境が追いつかなかったことはだれかが責められるものではないと思っています。
その努力の全てを皆さんにお伝えすることは出来かねますが、3ヶ月間本当に努力をしていたことは信じてあげてほしいです。たとえ演舞（ライブ）に出演出来なかったとしても、籍を残し、3ヶ月の間様子を見て環境が変わればいつでも戻って来てほしいという気持ちでした。

氏っ子の皆さまへ　より抜粋

と山本かなたの努力に対して最大限の賛辞を送っており、籍を残してでも戻れる様に考えていた運営側の気持ちが綴られている。

脱退の発表を受けて、山本かなたもTwitterに久しぶりに投稿をした。

ファンへのお礼と共に、脱退を申し入れた理由を述べており

生活環境の変化や身内の不幸、コロナなどいろいろなことが重なりグループへ出来る状況ではなくなってしまいました。
中途半端な状態で籍を残しているよりも、しっかりと決断をして前位に進むことがグループのためにも自分のためにも良いと判断し今回脱退の申し入れをさせてもらいました。

山本かなた Twitterコメント　より抜粋

自身で活動休止期間に悩んで出した答えであるとしている。

お久しぶりです。

公式から発表があった通り山本かなたは超！神様アイドルプロジェクトを脱退することになりました。

復帰を待ってくれていた皆様、本当にごめんなさい。
短い間でしたが応援してくださりありがとうございました！

このアカウントも来週にはなくなりますのでよろしくお願いします。 pic.twitter.com/d5MbRz63XT

— 山本かなた (@chokami_kanata) April 17, 2020

山本かなたの卒業ライブについては、新型コロナウイルス感染拡大防止のためライブが出来る状況ではないため、『本意ではございませんが卒業イベントは行うことが出来ない』と発表している。

超！神様アイドルプロジェクト公式頁：https://cho-kamipro.com/
超！神様アイドルプロジェクト公式 Twitterアカウント：@chokami2020
山本かなた Twitterアカウント：@chokami_kanata